[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي مقالات آماده انتشار آخرين شماره تمام شماره‌ها جستجو ثبت نام ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات مجله::
هیات تحریریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
خط مشی دبیری::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
بانک ها و نمایه ها::
::
شاپا
شاپاچاپی  
2228-7280
شاپا الکترونیکی
2228-7299
..
بانک ها و نمایه ها

 

 

 

 

 

 
..
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
لینک مفید بر ای داوران

سرقت ادبی وعلمی فارسی

سرقت ادبی وعلمی لاتین

..
دسترسی آزاد
مقالات این مجله با دسترسی آزاد توسط دانشگاه علوم پزشکی اردبیل تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
 
..
:: دوره 25، شماره 3 - ( پاییز 1404 ) ::
جلد 25 شماره 3 صفحات 318-304 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماران مبتلا به آزواسپرمی غیرانسدادی
فاطمه زهرا محمودی ، داریوش غلامی* ، علی محمدیان ، حسین عزیزی
گروه بیوانفورماتیک و زیست فناوری کاربردی، دانشکده زیست‌فناوری، دانشگاه تخصصی فناوری‌های نوین آمل، آمل، ایران. ، d.gholami@ausmt.ac.ir
چکیده:   (143 مشاهده)
زمینه و هدف: آزواسپرمی غیرانسدادی یکی از مهم‌ترین علل ناباروری در مردان است. مشخصه اصلی آن عدم وجود مکرر اسپرم در مایع منی یا تعداد کم اسپرم است و به‌طور کامل رشد نکرده است. هدف از این مطالعه یافتن ژن‌های کلیدی در بیماران آزواسپرمی غیرانسدادی و نقش آن‌ها است که ممکن است نشانگرهای زیستی مرتبط با اسپرم‌زایی را تحت تأثیر قرار دهد.
روش‌کار: با استفاده از مجموعه داده‌های رونویسی و توالی‌یابی در پایگاه‌ داده ژنی بیان ژن (GEO)، ژن‌های هاب مربوط به اسپرم‌زایی شناسایی شد. براساس آن‌ها، آنالیز غنی‌سازی عملکردی ژن (GO)، آنالیز مسیر غنی‌سازی ژن‌ها و ژنوم‌ (KEGG)، آنالیز شبکه تعامل پروتئین- پروتئین (PPI)، تجزیه و تحلیل سلولی و تحلیل زمانی در مجموع 50 ژن با بیان متفاوت شناسایی شد که از این میان، 5 ژن مربوط به اسپرم‌زایی (CDC20،BUB1B ، CCNB1، CCNA2 و PLK1) گزارش شده‌است و بیان این 5 ژن هاب در هر نوع سلول اسپرم متفاوت بود.
یافته‌ها: نتایج تجزیه و تحلیل از 5 ژن هاب نشان داد که طی اسپرماتوژنز، ژن‌های هاب در اسپرماتوسیت اولیه، اسپرماتید گرد، اسپرماتید دراز و اسپرم بیان شد. بیان PLK1 در بالاترین سطح بود. در تمایز اسپرماتوگونی و سلول‌های اولیه اسپرماتوسیت اولیه، CDC20 تقریباً بیان نشد، در حالی که BUB1B کم بیان شد و بیان CCNB1، CCNA2  بیشتر از BUB1B بودند.
نتیجه‌گیری: تحقیقات نشان داد که این 5 ژن هاب در مسیر رشد اسپرم متفاوت هستند و ممکن است نقش مهمی در سلول‌های اسپرم مختلف ایفا کنند. این نتیجه برای آشکار کردن مکانیسم بیماری‌زایی آزواسپرمی غیرانسدادی و تحقیقات بیشتر اهمیت زیادی دارد.

 
واژه‌های کلیدی: آزواسپرمی غیرانسدادی، اسپرم‌زایی، ژن هاب
متن کامل [PDF 650 kb]   (70 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله اصیل | موضوع مقاله: ژنتیک و پزشکی مولکولی
دریافت: 1404/6/15 | پذیرش: 1404/8/17 | انتشار: 1404/10/2
فهرست منابع
1. Gifford JH. The role of WNT signaling in adult ovarian folliculogenesis. Reproduction. 2015;150(4):R137-48. [DOI:10.1530/REP-14-0685]
2. Arafat M, Har-Vardi I, Harlev A, Levitas E, Zeadna A, Abofoul-Azab M, et al. Mutation in TDRD9 causes non-obstructive azoospermia in infertile men. J Med Genet. 2017;54(9):633-639. [DOI:10.1136/jmedgenet-2017-104514]
3. Wosnitzer M, Goldstein M, Hardy MP. Review of azoospermia. Spermatogenesis. 2014;4(1):e28218. [DOI:10.4161/spmg.28218]
4. Kohn TP, Pastuszak AW. Non-obstructive azoospermia and shortened leukocyte telomere length: further evidence linking poor health and infertility. Fertil Steril. 2018;110(4):629-630. [DOI:10.1016/j.fertnstert.2018.06.013]
5. Vij SC, Sabanegh Jr E, Agarwal A. Biological therapy for non-obstructive azoospermia. Expert Opin Biol Ther. 2018;18(1):19-23. [DOI:10.1080/14712598.2018.1380622]
6. Silber SJ, Van Steirteghem A, Nagy Z, Liu J, Tournaye H, Devroey P. Normal pregnancies resulting from testicular sperm extraction and intracytoplasmic sperm injection for azoospermia due to maturation arrest. Fertil Steril. 1996;66(1):110-117. [DOI:10.1016/S0015-0282(16)58396-4]
7. Song J, Gu L, Ren X, Liu Y, Qian K, Lan R, et al. Prediction model for clinical pregnancy for ICSI after surgical sperm retrieval in different types of azoospermia. Hum Reprod. 2020;35(9):1972-1982. [DOI:10.1093/humrep/deaa163]
8. Fang Y, Ji L, Zhu C, Xiao Y, Zhang J, Lu J, et al. Liraglutide alleviates hepatic steatosis by activating the TFEB-regulated autophagy-lysosomal pathway. Front Cell Dev Biol. 2020;8:574-602. [DOI:10.3389/fcell.2020.602574]
9. Dong M, Li H, Zhang X, Tan J. Weighted correlation gene network analysis reveals new potential mechanisms and biomarkers in non-obstructive azoospermia. Front Genet. 2021;12:133-617. [DOI:10.3389/fgene.2021.617133]
10. Zhong Y, Zhao J, Deng H, Wu Y, Zhu L, Yang M, et al. Integrative bioinformatics analysis to identify novel biomarkers associated with non-obstructive azoospermia. Front Immunol. 2023;14:1088-1261. [DOI:10.3389/fimmu.2023.1088261]
11. Qi Y, Wu Y, Pang K, Cao Y, Li H, Qiao Y, et al. Profiling of circulating extracellular vesicle microRNAs reveals diagnostic potential and pathways in non-obstructive and obstructive azoospermia. Biol Reprod. 2024;111(6):1297-1310. [DOI:10.1093/biolre/ioae130]
12. Davis S, Meltzer PS. GEOquery: a bridge between the Gene Expression Omnibus (GEO) and BioConductor. Bioinformatics. 2007;23(14):1846-1847. [DOI:10.1093/bioinformatics/btm254]
13. Core Team R. R: A Language and Environment for Statistical Computing. Vienna. R Foundation for Statistical Computing; 2020.
14. Ritchie ME, Phipson B, Wu D, Hu Y, Law CW, Shi W, et al. limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies. Nucleic Acids Res. 2015;43(7):e47. [DOI:10.1093/nar/gkv007]
15. Xie Z, Bailey A, Kuleshov MV, Clarke DJ, Evangelista JE, Jenkins SL, et al. Gene set knowledge discovery with Enrichr. Curr Protoc. 2021;1(3):e90. [DOI:10.1002/cpz1.90]
16. Wickham H. Data Analysis. Springer. 2016. [DOI:10.1007/978-3-319-24277-4_9]
17. Szklarczyk D, Kirsch R, Koutrouli M, Nastou K, Mehryary F, Hachilif R, et al. The STRING database in 2023: protein-protein association networks and functional enrichment analyses for any sequenced genome of interest. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D638-46. [DOI:10.1093/nar/gkac1000]
18. Shannon P, Markiel A, Ozier O, Baliga NS, Wang JT, Ramage D, et al. Cytoscape: a software environment for integrated models of biomolecular interaction networks. Genome Res. 2003;13(11):2498-2504. [DOI:10.1101/gr.1239303]
19. Chin CH, Chen SH, Wu HH, Ho CW, Ko MT, Lin CY. cytoHubba: identifying hub objects and sub-networks from complex interactome. BMC Syst Biol. 2014;8:1-7. [DOI:10.1186/1752-0509-8-S4-S11]
20. Neto FTL, Bach PV, Najari BB, Li PS, Goldstein M. Spermatogenesis in humans and its affecting factors. In: Seminars in Cell & Developmental Biology. Amsterdam: Elsevier; 2016. [DOI:10.1016/j.semcdb.2016.04.009]
21. La HM, Hobbs RM. Mechanisms regulating mammalian spermatogenesis and fertility recovery following germ cell depletion. Cell Mol Life Sci. 2019;76:4071-4102. [DOI:10.1007/s00018-019-03201-6]
22. Singh V, Jaiswal D, Singh K, Trivedi S, Agrawal NK, Gupta G, et al. Azoospermic infertility is associated with altered expression of DNA repair genes. DNA Repair. 2019;75:39-47. [DOI:10.1016/j.dnarep.2019.01.006]
23. Law NC, Oatley MJ, Oatley JM. Developmental kinetics and transcriptome dynamics of stem cell specification in the spermatogenic lineage. Nat Commun. 2019;10(1):27-87. [DOI:10.1038/s41467-019-10596-0]
24. Goto C, Tamura K, Nishimaki S, Maruyama D, Hara-Nishimura I. The nuclear envelope protein KAKU4 determines the migration order of the vegetative nucleus and sperm cells in pollen tubes. J Exp Bot. 2020;71(20):6273-6281. [DOI:10.1093/jxb/eraa367]
25. Kavarthapu R, Anbazhagan R, Sharma AK, Shiloach J, Dufau ML. Linking phospho-gonadotropin regulated testicular RNA helicase (GRTH/DDX25) to histone ubiquitination and acetylation essential for spermatid development during spermiogenesis. Front Cell Dev Biol. 2020;8:31-40. [DOI:10.3389/fcell.2020.00310]
26. Rodríguez-Casuriaga R, Geisinger A. Contributions of flow cytometry to the molecular study of spermatogenesis in mammals. Int J Mol Sci. 2021;22(3):11-51. [DOI:10.3390/ijms22031151]
27. Kanakkanthara A, Jeganathan KB, Limzerwala JF, Baker DJ, Hamada M, Nam HJ, et al. Cyclin A2 is an RNA binding protein that controls Mre11 mRNA translation. Science. 2016;353(6307):1549-52. [DOI:10.1126/science.aaf7463]
28. Manic G, Corradi F, Sistigu A, Siteni S, Vitale I. Molecular regulation of the spindle assembly checkpoint by kinases and phosphatases. Int Rev Cell Mol Biol. 2017;328:105-161. [DOI:10.1016/bs.ircmb.2016.08.004]
29. Lin YM, Teng YN, Chung CL, Tsai WC, Lin YH, Lin JSN, et al. Decreased mRNA transcripts of M-phase promoting factor and its regulators in the testes of infertile men. Hum Reprod. 2006;21(1):138-144. [DOI:10.1093/humrep/dei285]
30. Ma Q, Liu Y, Shang L, Yu J, Qu Q. The FOXM1/BUB1B signaling pathway is essential for the tumorigenicity and radioresistance of glioblastoma. Oncol Rep. 2017;38(6):3367-3375. [DOI:10.3892/or.2017.6032]
31. He H, Yu F, Shen W, Chen K, Zhang L, Lou S, et al. The novel key genes of non-obstructive azoospermia affect spermatogenesis: transcriptomic analysis based on RNA-Seq and scRNA-Seq data. Front Genet. 2021;12:608-629. [DOI:10.3389/fgene.2021.608629]
32. Shen Y, Wu X, Li Q, Huang X, Wang J, Zhao L, et al. Identification and potential value of candidate genes in patients with non-obstructive azoospermia. Urology. 2022;164:133-139. [DOI:10.1016/j.urology.2022.02.009]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA

Ethics code: https://ethics.research.ac.ir/IR.ASMT.REC.1403.010


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Mahmoudi F Z, Gholami D, Mohammadian A, Azizi H. Identification of Key Genes in Patients with Non-Obstructive Azoospermia. J Ardabil Univ Med Sci 2025; 25 (3) :304-318
URL: http://jarums.arums.ac.ir/article-1-2540-fa.html

محمودی فاطمه زهرا، غلامی داریوش، محمدیان علی، عزیزی حسین. شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماران مبتلا به آزواسپرمی غیرانسدادی. مجله دانشگاه علوم پزشکی اردبیل. 1404; 25 (3) :304-318

URL: http://jarums.arums.ac.ir/article-1-2540-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 25، شماره 3 - ( پاییز 1404 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی اردبیل Journal of Ardabil University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 43 queries by YEKTAWEB 4623